El Colegio Mayor Mendaur es una institución que participa del proyecto educativo de la Universidad de Navarra y contribuye a su desarrollo. En Mendaur, esto se traduce en el deseo de que sus colegiales terminen la etapa universitaria siendo personas maduras, que impulsen la convivencia y la amistad; convertidos en buenos profesionales, con una formación completa, tanto humana como académica; y con capacidad crítica, que sepan reconocer la verdad, admirarse ante ella y defenderla.
El proyecto formativo del Colegio Mayor Mendaur contribuye al desarrollo de todas estas facetas. Por ello, la vida colegial y las actividades que se organizan en Mendaur se proponen estos cuatro grandes objetivos: